Les publications regroupées dans l'Encyclopédie de droit politique sont indexées suivant plusieurs critères matériels.
L'essentiel des documents présentés dans l'Encyclopédie tiennent, d'une part, à l'étude de crises constitutionnelles déterminées, marquantes dans l'histoire constitutionnel des Etats concernés et dans l'histoire du constitutionnalisme, et d'autre part, à l'analyse des grandes notions et problématiques du droit politique. Ces différentes crises constitutionnelles et ces grandes notions de droit politique font l'objet de dossiers documentaires spécifiques (index des documents et articles par thèmes).
Afin de faciliter la consultation des publications réunies dans l'Encyclopédie, le site propose également une indexation par mots-clés et par auteurs.